《厦门大学学报（自然科学版）》（双月刊）创刊于1931年，是由厦门大学主办、国内外公开发行的综合性学术期刊，是中国优秀科技期刊、中国自然科学核心期刊。 《厦门大学学报（自然科学版）》主要刊载数学，物理学，计算机与信息工程，技术科学，化学，化工，海洋学，环境科学，生命科学等学科的最新研究成果。本刊坚持党的基本路线，提倡“双百”方针，以促进科学技术的发展，为传播科技成果，发现和培养科技人才提供了一个总结经验、相互交流的园地。获奖情况：多次被评为全国、华东地区、福建省的优秀科技期刊；2001年入选国家新闻出版总署评定的"中国期刊方阵"；2003年获国家新闻出版总署颁发的"第二届国家科技期刊百种重点期刊"奖；2006年获国家教育部科技司颁发的"首届中国高校精品科技期刊"奖；国家“双效”期刊。
《厦门大学学报》（哲学社会科学版）（双月刊）创办于1926年4月，是厦门大学主办、国家教育部主管的高层次的哲学社会科学综合性学术刊物，办刊历史悠久。 《厦门大学学报》（哲学社会科学版）在新中国成立后，由当时的厦门大学校长、著名经济学家王亚南亲自筹划，《厦门大学学报》在停办七年之后，于1952年7月复刊，成为解放后最早复办的大学学报，对后来全国各高校学报的复刊或创刊，起了积极的推动作用，因而受到教育部的表扬。获奖情况：全国双十佳社科学报（第一、二届）。